Le Conseil de l’Institut, présidé par le Directeur Général, est l’organe suprême de l’Académie des Beaux-Arts de Kinshasa. Il comprend : les membres du Comité de gestion, les représentants des corps académique, scientifique, administratif et technique ; les représentants de Sections et celui des étudiants. Le Directeur Général, en dehors de son appartenance au Conseil de l’Institut et au Comité de gestion qu’il préside, constitue en lui-même un organe à part entière.
Le Comité de gestion, organe de gestion et d’exécution, comprend quatre membres :
Aussi, les Conseils de Sections et les Conseils de Départements sont les organes qui gèrent leurs entités décentralisées respectives.